Arama motoru optimizasyonu yanlış yapıldığı durumlarda sitenizin içeriğininde yanlış tanınması yada değersiz olarak algılanması bile mümkündür. Bunun dışında arama motoru optimizasyonu örneğin flaş sitelerde okuyamadığı için yapılamamkta bu nedenle meta tag lerine güvenilmektedir. Metalarda düzgün olmadığı takdirde zaten sitenizin içeriği okunmuyor içerik hakkında ipucu verecek şeylerde doğru değil çok yanlış bir indexlemeye neden olur ve google tarafından pagerank ınız düşürülerek alt sıralarda çıkarsınız çok ileri sayfalarda çıkarsınız ve hiç bir işe yaramaz. Bunun dışında arama motoru optimizasyonunda black art white art de denilen iki teknik vardır. White art SEO dediğimiz yani bütün herşeyi kuralına göre yapmak bütün google nin önerdiği şekilde yapmak birde black art dediğimiz daha farklı yöntemler kullanılarak yasada açık bulmak gibi bir yötemle server çalışmaları yapılmaktadır. Ancak bu şekilde yapıldığında bile tespit edildiğinde siteniz cezalandırılarak arama sonuçlarında çok çok ileri sayfalarda çıkmakta aylarca bu ceza sürebilmektedir.
Arama motorunda sık yapılan hatalar içeriği doğru yansıtmamak onun dışında alt yapıda yanlış ögeler kullanmak semantik açıdan eksik ögeler kullanmak gibi şeyler gösterilebilir. Bu nedenle arama motoru optimizasyonuzu doğru yapabilmek için optimizasyonu düzgün yapılmış siteleri inceleyebilirsiniz, dökümantasyonu okuyabilirsiniz ve yahut bu iş hakkında çalışan bu işi bilen birinden yardım alarak bu işlemi gerçekleştirebilirsiniz.