Bebeklerde gıdalara bağlı reaksiyonların aslında bir çoğu alerjik reaksiyonlar değildir. Örneğin bir bebeğin ağzına, dudaklarına bir gıda değdiği zaman bu süt olabilir meyve olabilir sebze olabilir etrafında bir kızaklık oluşması illaki bir alerjik reaksiyon belirtisi değildir. Bunların bir çoğu bir çeşit kimyasal, biyolojik reaksiyon, tahriş şeklinde reaksiyon olarak oraya çıkacaktır. Alerjik reaksiyonlar ise yine aynı belirtiyi verebilir. Yani gıdanın değdiği cilt bölgesinde olabileceği gibi ağız bölgesinde, dilde şişme tarzında olabilir veya gıdanın geçtiği bütün sindirim sistemi boyunca bir alerjik hastalığa sebep olabilir. Bu belirtiler özellikle sindirim zorluğu, kusma, sancı hatta infantil kolik tarzında da ortaya çıkabilir. Yani uzun süre ağlamalar, sancılar, gaz sancısı zannedilen sancılar şeklinde ortaya çıkabilir. Sadece kilo kaybı ya da kilo alamama tarzında da ortaya çıkabilir. Fakat sık rastlanan türüyle ishal bebelerde özellikle süt ve süt ürünlerine bağlı protein alerjilerinde en sık görülen belirtidir. Enterokolit denilen bir tabloya sebep olabilir ve bu enterokolitler de dizanteriye benzeyen bebeklerde kanlı, sümüklü, yeşil renkli 1 haftadan fazla uzun süren ishaller görülebilir. Bu ishaller bebeklerde ciddi beslenme yetersizliğine büyüme ve gelişme geriliğine sebep olabilir. Nadiren kabızlık şeklinde de karşımıza çıkabilir.